之所以使用真空干燥，其主要目的在于“低温干燥”，因为提高真空度可有效降低液体沸点，从而使固液分离速度加快，而指定的干燥温度是该固液混合物中液体在标称真空度下的佳蒸发温度，提前升温对于加快蒸发速度没有特别大的正向作用，反而会导致热量浪费和混合物受热时间过长等问题。
     而且，对于有内部搅拌的干燥器，由于抽真空时可导致混合物内部发生轻微崩裂，有利于避免干燥结球，而未抽真空升温甚至开始搅拌的话，有可能会导致大范围的结球现象。
　　　如果先加热再抽真空的话，真空泵从工作室内吸进的气体是膨胀后的热气，一个会对真空泵损耗加剧，二会使得箱内真空度到不到，摆放的样品可能会被氧化。
  再使用后如果没及时移开真空泵跟箱体连接的硅胶管，很容易造成倒吸。即使负压表回复到零后箱门很难打开.